Il Papa presiede la Santa Messa presso la Basilica di Santa Maria degli Angeli, con omelia del Santo Padre. Prima della benedizione finale un giovane ringrazia il Papa per l'incontro. La celebrazione si conclude con il mandato missionario, un invio simbolico che chiama i giovani d'Europa a riportare nelle proprie terre la freschezza del Vangelo e la letizia francescana. Alle 12:00 il Santo Padre lascia la Basilica; alle 12:15 si congeda dalle autorità all'elicottero e alle 12:45 atterra all'eliporto del Vaticano. Nell'omelia, commentando il Vangelo della Trasfigurazione alla luce della spiritualità francescana, il Papa afferma che "la ragione per cui San Francesco, ottocento anni dopo la sua morte, ci attrae ancora, sta nella magnifica umanità che lo portò ad abbandonare le vie già tracciate", ricordando anche la scelta "ancora più impressionante" di Santa Chiara, che volle vivere libera come i frati francescani: espressione, per il Papa, dell'"energia del cristianesimo, quella dei suoi inizi e delle sue molteplici ripartenze". Secondo la memoria dei frati, è la prima volta che un Romano Pontefice presiede una celebrazione eucaristica nella Basilica di Santa Maria degli Angeli.