O Papa preside a Santa Missa na Basílica de Santa Maria dos Anjos, com homilia do Santo Padre. Antes da bênção final, um jovem agradece ao Papa pelo encontro. A celebração termina com o mandato missionário, um envio simbólico que chama os jovens da Europa a levarem de volta às suas terras a frescura do Evangelho e a alegria franciscana. Às 12h00 o Santo Padre deixa a Basílica; às 12h15 despede-se das autoridades junto ao helicóptero e às 12h45 aterrissa no heliporto do Vaticano. Na homilia, comentando o Evangelho da Transfiguração à luz da espiritualidade franciscana, o Papa afirma que "a razão pela qual São Francisco, oitocentos anos após sua morte, ainda nos atrai, está na magnífica humanidade que o levou a abandonar os caminhos já traçados", recordando também a escolha "ainda mais impressionante" de Santa Clara, que quis viver livre como os frades franciscanos: expressão, para o Papa, da "energia do cristianismo, a de seus inícios e de seus múltiplos recomeços". Segundo a memória dos frades, é a primeira vez que um Romano Pontífice preside uma celebração eucarística na Basílica de Santa Maria dos Anjos.